46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2598 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 691 aa  1367    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  46.54 
 
 		 680 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  49.79 
 
 		 680 aa  343  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  44.79 
 
 		 680 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.88 
 
 		 548 aa  330  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.65 
 
 		 659 aa  327  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  49.01 
 
 		 674 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.4 
 
 		 682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.98 
 
 		 529 aa  271  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.32 
 
 		 590 aa  267  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.98 
 
 		 693 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  43.1 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.28 
 
 		 575 aa  246  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.29 
 
 		 587 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.21 
 
 		 676 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  38.99 
 
 		 1537 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.93 
 
 		 684 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.56 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.36 
 
 		 627 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  30.11 
 
 		 706 aa  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  28.47 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.03 
 
 		 404 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  32.75 
 
 		 666 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.82 
 
 		 830 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.17 
 
 		 449 aa  125  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.09 
 
 		 824 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  59.06 
 
 		 232 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  27.9 
 
 		 444 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30 
 
 		 1672 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  27.59 
 
 		 651 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  47.83 
 
 		 143 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  29.39 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  27 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.36 
 
 		 486 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  25.34 
 
 		 1069 aa  71.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  26.72 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  26.91 
 
 		 458 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1383  FeS assembly protein SufD  28.81 
 
 		 162 aa  54.3  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000313587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  28.16 
 
 		 410 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  26.19 
 
 		 1538 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46243  predicted protein  22.76 
 
 		 640 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1299  hypothetical protein  33.67 
 
 		 195 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.62 
 
 		 595 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1646  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 341 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2650  agarase  38.24 
 
 		 787 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000351829  normal  0.0319277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3186  hypothetical protein  32.63 
 
 		 255 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000364284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>