75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0423 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  100 
 
 		 824 aa  1598    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  67.03 
 
 		 830 aa  1054    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  35.68 
 
 		 706 aa  208  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  38.18 
 
 		 666 aa  196  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.98 
 
 		 404 aa  173  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.86 
 
 		 1537 aa  168  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  34.12 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.24 
 
 		 575 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.18 
 
 		 680 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.49 
 
 		 659 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.84 
 
 		 676 aa  151  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.15 
 
 		 693 aa  147  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.98 
 
 		 609 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.91 
 
 		 548 aa  141  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.08 
 
 		 682 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.36 
 
 		 627 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.41 
 
 		 590 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.16 
 
 		 674 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.55 
 
 		 680 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.21 
 
 		 529 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.31 
 
 		 680 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.1 
 
 		 684 aa  134  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  57 
 
 		 1394 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 691 aa  121  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.13 
 
 		 587 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  30.3 
 
 		 651 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.39 
 
 		 406 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.91 
 
 		 486 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  34.64 
 
 		 2353 aa  90.5  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  31.06 
 
 		 444 aa  87.4  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  40.54 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.16 
 
 		 595 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.88 
 
 		 2313 aa  78.2  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.97 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  54.17 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.44 
 
 		 1672 aa  74.3  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  31.17 
 
 		 458 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  28.49 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  29.97 
 
 		 645 aa  72  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  29.94 
 
 		 1069 aa  71.2  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  38.32 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  43.65 
 
 		 916 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  53.85 
 
 		 356 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  31.03 
 
 		 671 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  36.81 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3042  PKD  35.14 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.971034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  25.91 
 
 		 1538 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  43.53 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2486  S-antigen family protein  35.74 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.13457  normal  0.608286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  51.76 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  40.5 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  60 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  55.26 
 
 		 846 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  41.06 
 
 		 476 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  25.24 
 
 		 410 aa  55.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4699  hypothetical protein  34.07 
 
 		 178 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  45.74 
 
 		 914 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  48.99 
 
 		 1159 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  32.02 
 
 		 1096 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.63 
 
 		 445 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  28.95 
 
 		 407 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  36.04 
 
 		 778 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  27.2 
 
 		 2764 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  60.68 
 
 		 675 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  33.76 
 
 		 504 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  54.24 
 
 		 338 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  52.44 
 
 		 455 aa  47.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2250  hypothetical protein  53.45 
 
 		 183 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  35.63 
 
 		 489 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2302  hypothetical protein  51.72 
 
 		 177 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668841  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  41.44 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 834 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  54.41 
 
 		 202 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  45.1 
 
 		 735 aa  45.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  45.79 
 
 		 259 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>