37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5100 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  100 
 
 
548 aa  1107    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  52.88 
 
 
659 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  54.85 
 
 
680 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  51.97 
 
 
680 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  51.05 
 
 
682 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50.32 
 
 
680 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  47.83 
 
 
529 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.57 
 
 
575 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  46.15 
 
 
693 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.77 
 
 
676 aa  364  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50 
 
 
674 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.22 
 
 
684 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
691 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.76 
 
 
587 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.13 
 
 
590 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  44.99 
 
 
406 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.83 
 
 
609 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  38.33 
 
 
1537 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.93 
 
 
627 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  34.02 
 
 
706 aa  209  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  32.58 
 
 
666 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  30.44 
 
 
466 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  82.95 
 
 
143 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.91 
 
 
824 aa  143  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.11 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.97 
 
 
830 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  51.47 
 
 
232 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.09 
 
 
486 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  31.16 
 
 
444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  24.38 
 
 
651 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.5 
 
 
449 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.52 
 
 
1672 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  29.61 
 
 
645 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  27.44 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  30 
 
 
431 aa  63.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  24.57 
 
 
396 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.8 
 
 
595 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>