14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39253 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  100 
 
 		 1538 aa  3076    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  26.21 
 
 		 830 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  30.32 
 
 		 1069 aa  74.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.27 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.76 
 
 		 1537 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 691 aa  62.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  25.41 
 
 		 645 aa  62  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  26.07 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.68 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  24 
 
 		 404 aa  55.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.68 
 
 		 587 aa  51.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.19 
 
 		 449 aa  49.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  32.77 
 
 		 444 aa  47.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46243  predicted protein  24.06 
 
 		 640 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>