18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2650 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  100 
 
 
1194 aa  2450    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  37.74 
 
 
847 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  34.71 
 
 
628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  32.62 
 
 
629 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  33.33 
 
 
626 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  27.04 
 
 
624 aa  194  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  26.88 
 
 
618 aa  171  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.68 
 
 
1246 aa  155  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  24.55 
 
 
843 aa  90.5  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  23.92 
 
 
628 aa  58.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  21.33 
 
 
1200 aa  51.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3974  hypothetical protein  30.53 
 
 
186 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  34.88 
 
 
2042 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  24.04 
 
 
1346 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  27.59 
 
 
535 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  32.1 
 
 
2690 aa  46.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  27.94 
 
 
647 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  27.27 
 
 
483 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>