12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0445 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0445  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 964 aa  1884    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.265676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  26.5 
 
 		 1348 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.07 
 
 		 1337 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  29.68 
 
 		 1346 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  27.37 
 
 		 1433 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  27.46 
 
 		 1437 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.59 
 
 		 2507 aa  58.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  26.61 
 
 		 749 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  42.35 
 
 		 500 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  26.22 
 
 		 752 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  36.63 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  26.79 
 
 		 474 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>