19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2057 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2057  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 282 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2730  hypothetical protein  41.51 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0392858  normal  0.0235796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1948  integrins alpha chain  39.41 
 
 		 265 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0825515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3167  Integrins alpha chain  37.44 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2098  hypothetical protein  35.9 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1066  hypothetical protein  35.67 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3983  hypothetical protein  31.25 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00134257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4816  hypothetical protein  31.19 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.783892  normal  0.123589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  32.19 
 
 		 1527 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4667  hypothetical protein  31.19 
 
 		 381 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.69 
 
 		 3193 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  31.71 
 
 		 760 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4298  hypothetical protein  30.88 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.379681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  34.48 
 
 		 566 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.9 
 
 		 2194 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  32.81 
 
 		 883 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.86 
 
 		 1222 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.12 
 
 		 1154 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 		 635 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>