More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0957 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 626 aa  1283    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  41.54 
 
 		 603 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  39.16 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  39.78 
 
 		 613 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  40.81 
 
 		 612 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  36.17 
 
 		 664 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  39.45 
 
 		 540 aa  329  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  38.93 
 
 		 527 aa  316  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  40.86 
 
 		 519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  31.91 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 549 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 572 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 481 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 506 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 591 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 522 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.51 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 481 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.3 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 601 aa  117  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 534 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 491 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 501 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 494 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 507 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 496 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 494 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 491 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 592 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 514 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.67 
 
 		 499 aa  97.8  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 556 aa  97.8  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 521 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 514 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 498 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.34 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 470 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 521 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 503 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 522 aa  94  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 541 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  29.41 
 
 		 458 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 478 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 477 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 502 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 549 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  32.29 
 
 		 506 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 574 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 485 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 488 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.6 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.09 
 
 		 487 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 519 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 540 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 460 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  31.42 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 624 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  34.13 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.73 
 
 		 532 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  24.89 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.9 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  22.63 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  23.42 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>