More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3634 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 508 aa  1048    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  42.27 
 
 		 511 aa  359  8e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  42.17 
 
 		 499 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  40.66 
 
 		 506 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  36.91 
 
 		 487 aa  258  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  35.91 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  36.96 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  36.06 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  35.05 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  33.65 
 
 		 502 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  33.09 
 
 		 541 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  33.78 
 
 		 494 aa  206  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  33.46 
 
 		 493 aa  203  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  34.31 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  34.38 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  33.14 
 
 		 483 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  31.43 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  33.54 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  30.23 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.59 
 
 		 486 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  30.54 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.5 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.07 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  31.5 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  31.02 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  33.63 
 
 		 497 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  30.07 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  31.87 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 488 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 582 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  32.04 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  34.56 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.75 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 594 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  33.48 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 507 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 588 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 570 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  30.26 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  31.53 
 
 		 491 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  29.55 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 514 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  32.24 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 592 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.79 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  30.02 
 
 		 507 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  31.91 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 547 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.32 
 
 		 532 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  30.89 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 485 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 548 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 461 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  29.44 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 447 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 557 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>