More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2432 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 499 aa  1025    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  66.73 
 
 		 493 aa  667    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  33.91 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  33.27 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  36.42 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  32.77 
 
 		 499 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  34.41 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  35.05 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  31.38 
 
 		 520 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  32.63 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.67 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  33.91 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 		 502 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 476 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 		 541 aa  190  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  34.5 
 
 		 497 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  33.14 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.78 
 
 		 487 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.79 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 500 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.12 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.48 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  39.21 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.7 
 
 		 511 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  30.76 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  30.35 
 
 		 531 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  31.43 
 
 		 498 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  30.68 
 
 		 483 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 594 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.03 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.1 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 470 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 523 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 570 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 479 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 592 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 592 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 527 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  33.11 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 540 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 598 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 508 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 579 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.24 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 601 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 549 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  30.23 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.57 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 457 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29.36 
 
 		 461 aa  126  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  29.65 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.82 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 603 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.91 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 664 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>