More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1122 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 511 aa  1066    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  42.27 
 
 		 508 aa  359  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  40.48 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  39.25 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  32.83 
 
 		 506 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  35.25 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.66 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  32.91 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  34.65 
 
 		 486 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  32.63 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  34.23 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 500 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  39.21 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 481 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.98 
 
 		 494 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  30.85 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 502 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 478 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  33.76 
 
 		 514 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.42 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 511 aa  151  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 495 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  31.46 
 
 		 497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 570 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.12 
 
 		 507 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 507 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.49 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 		 519 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 460 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 498 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 594 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 592 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.48 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 503 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  30.97 
 
 		 498 aa  126  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 557 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 531 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 511 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  31.31 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.67 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.35 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 582 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 601 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 484 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 598 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 549 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 521 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 556 aa  113  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 565 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 568 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 527 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 540 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>