More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2021 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 507 aa  1043    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  42.69 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  33.08 
 
 		 477 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  32.95 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.02 
 
 		 490 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 523 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 531 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.48 
 
 		 483 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.49 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.73 
 
 		 494 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.6 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.22 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 598 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.13 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 582 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 514 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 529 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  28.94 
 
 		 511 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 506 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 498 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 499 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 501 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 582 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 511 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 601 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 503 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 549 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 592 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 594 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 576 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 592 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 487 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 592 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 531 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 493 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 570 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 540 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 579 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.91 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 548 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.85 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.49 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 549 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 519 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 541 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 479 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 549 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 574 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.83 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 470 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>