More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0773 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 483 aa  984    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  49.48 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  46.89 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  44.14 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  43.59 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  40.81 
 
 		 491 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  42.09 
 
 		 477 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  42.52 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  41.14 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  42.23 
 
 		 501 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  41.55 
 
 		 477 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  41.14 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  40.95 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  39.02 
 
 		 500 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  41.01 
 
 		 470 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  39.73 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  38.84 
 
 		 485 aa  283  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  38.61 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  40.29 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  38.37 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  39.09 
 
 		 506 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  36.85 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  38.78 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  37.2 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  36.51 
 
 		 486 aa  256  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  37.14 
 
 		 522 aa  250  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  37.14 
 
 		 510 aa  242  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  38.02 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  34.99 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  34.34 
 
 		 514 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  35.93 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  37.18 
 
 		 511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  37.05 
 
 		 512 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  34.68 
 
 		 507 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  36.42 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  35.09 
 
 		 486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  35.99 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  35.16 
 
 		 499 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  35.2 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  36.06 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  32.2 
 
 		 520 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  34.1 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  35.08 
 
 		 521 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  33.7 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  32.5 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  33.47 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  33.53 
 
 		 513 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  33.84 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  32.49 
 
 		 487 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  32.18 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 480 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  33.84 
 
 		 521 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  34.23 
 
 		 511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  32.28 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 527 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  32.48 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  31.07 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 519 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 481 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  31.63 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  32.09 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 504 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 506 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 522 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 549 aa  173  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 531 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 492 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 511 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  33.25 
 
 		 503 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  31.16 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  30.8 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  30.22 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  32 
 
 		 532 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  31.38 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 461 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 594 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 495 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 582 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 576 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 592 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  30.69 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  32.92 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>