More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1656 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 497 aa  1016    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  46.29 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  45.78 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  44.68 
 
 		 519 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  40.35 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  40.57 
 
 		 514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  39.11 
 
 		 501 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  39.73 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  38.99 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  38.02 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  36.08 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  37.82 
 
 		 479 aa  263  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  37.05 
 
 		 481 aa  259  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  35.23 
 
 		 491 aa  239  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.83 
 
 		 494 aa  230  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 473 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 483 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.41 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  35.6 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  33.86 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  33.27 
 
 		 488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  34.81 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.22 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 499 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  32.94 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 492 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  32.69 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 485 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  34.5 
 
 		 499 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.56 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  32.81 
 
 		 506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 540 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.11 
 
 		 490 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.48 
 
 		 511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  33.63 
 
 		 508 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  30.53 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 523 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  31.9 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.83 
 
 		 511 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  31.46 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.69 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 503 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  28.84 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  31.07 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 489 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.43 
 
 		 507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 513 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 531 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 504 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  30.17 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  28.52 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 520 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.31 
 
 		 506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 613 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 541 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 529 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 495 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  30.09 
 
 		 511 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>