More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2730 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  100 
 
 
447 aa  905    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  54.48 
 
 
447 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  54.16 
 
 
448 aa  485  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  48.49 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  46.83 
 
 
457 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  44.49 
 
 
458 aa  359  6e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  40.83 
 
 
447 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 
478 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  32.93 
 
 
477 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  32.55 
 
 
457 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 
469 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 
492 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 
472 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.27 
 
 
479 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  29.96 
 
 
464 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  30.75 
 
 
466 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 
477 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  31.6 
 
 
456 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 
479 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 
456 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 
500 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 
483 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  28.85 
 
 
471 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 
460 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 
484 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 
476 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 
510 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  30 
 
 
451 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 
461 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 
481 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.97 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.27 
 
 
494 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 
491 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.04 
 
 
487 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 
506 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 
472 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 
480 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.51 
 
 
490 aa  136  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 
452 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 
456 aa  133  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 
497 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 
464 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 
506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 
480 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 
514 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  26.72 
 
 
467 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 
540 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 
483 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 
448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 
494 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 
466 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 
514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 
512 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 
470 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 
522 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 
511 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 
498 aa  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 
519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 
483 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 
473 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 
488 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 
491 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 
489 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.97 
 
 
498 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 
501 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 
498 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 
508 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 
486 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 
491 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 
664 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 
484 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  30.1 
 
 
486 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 
503 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  28.3 
 
 
471 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 
523 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 
527 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  24.08 
 
 
510 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 
522 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 
507 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>