More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3250 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 511 aa  1063    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  53.58 
 
 		 504 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  43.49 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 488 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 506 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.97 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.05 
 
 		 508 aa  152  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.41 
 
 		 494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 497 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 494 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.32 
 
 		 490 aa  140  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 477 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 480 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 484 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 486 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 541 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 531 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.94 
 
 		 507 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 527 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.96 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.4 
 
 		 498 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 491 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 549 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 506 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 489 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 548 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  26.91 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 603 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 513 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 520 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.57 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 582 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 523 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 504 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 503 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 534 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.27 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 618 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 582 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 547 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 502 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.96 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.87 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 498 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 540 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26.66 
 
 		 565 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 588 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 576 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 521 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 519 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.62 
 
 		 531 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.65 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 530 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 495 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 557 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  24.77 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 505 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.09 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>