More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11493 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  100 
 
 		 476 aa  967    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  31.91 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 502 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.26 
 
 		 511 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  33.89 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 510 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.09 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.32 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.79 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  30.68 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 499 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.26 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  29.88 
 
 		 483 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 501 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.96 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  31.9 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.18 
 
 		 532 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 491 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 470 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 511 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.01 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 519 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 519 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 500 aa  133  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.87 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 520 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.82 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.83 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 523 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.62 
 
 		 511 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29.37 
 
 		 461 aa  123  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 507 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 448 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 447 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.33 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  26.58 
 
 		 531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  26.82 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 499 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 531 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 456 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.95 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 487 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 508 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 531 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 588 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 574 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>