More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2413 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 480 aa  986    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  45.77 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  46.61 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  37.08 
 
 		 476 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  34.84 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  33.74 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.88 
 
 		 490 aa  207  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.74 
 
 		 494 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.31 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 483 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 499 aa  186  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  33.53 
 
 		 478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  32.02 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  31.7 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  32.09 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.59 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  32.61 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 479 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.65 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  29.41 
 
 		 506 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31.55 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.81 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 519 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  32.09 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 500 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  29.57 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  27.35 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 522 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 533 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 488 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 514 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 499 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 503 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.07 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 548 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 556 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 498 aa  133  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 478 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  27.82 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  31.24 
 
 		 612 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 426 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  31.57 
 
 		 511 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 513 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.65 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.16 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 622 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.79 
 
 		 458 aa  126  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 508 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 582 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 495 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 603 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>