More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6287 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 531 aa  1086    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  73.05 
 
 		 531 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  40.98 
 
 		 527 aa  312  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  37.84 
 
 		 540 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  35.69 
 
 		 557 aa  264  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  31.47 
 
 		 548 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  32.17 
 
 		 529 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  35.2 
 
 		 568 aa  223  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  33.03 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  34.37 
 
 		 555 aa  219  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  31.05 
 
 		 549 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  32.74 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 		 594 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  33.39 
 
 		 559 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  32.55 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 584 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 565 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 540 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  28.59 
 
 		 599 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 476 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 593 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  32.77 
 
 		 566 aa  180  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 564 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 481 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 571 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 615 aa  173  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  29.72 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 568 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 579 aa  170  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 494 aa  170  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 582 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 499 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.64 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 611 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 507 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 541 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 502 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 479 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 460 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 576 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 568 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 595 aa  150  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.8 
 
 		 494 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.14 
 
 		 490 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 576 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 491 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 587 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 478 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 642 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 623 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 522 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 534 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 587 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.4 
 
 		 511 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 511 aa  123  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 638 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 581 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 497 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 596 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 500 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 636 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 531 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>