More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0322 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 534 aa  1094    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 476 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 477 aa  176  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.55 
 
 		 481 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.67 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 499 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.05 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 502 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 494 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 527 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 513 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 512 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 519 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 510 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 503 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 555 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 601 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.53 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 531 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 491 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 548 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 549 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  28.38 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 505 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 556 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 527 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.38 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 614 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 487 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 503 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 584 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.16 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 533 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.37 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.58 
 
 		 498 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 612 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 549 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.36 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.87 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.96 
 
 		 494 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 520 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.07 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>