294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4531 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 614 aa  1272    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  43.06 
 
 		 582 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 579 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 600 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 511 aa  112  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 498 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 529 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 565 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 508 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 629 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 564 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 568 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 473 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 527 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  26.66 
 
 		 587 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  39.88 
 
 		 477 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 557 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 584 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 599 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 593 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 624 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 617 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 594 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 481 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 506 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 636 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 633 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  32.43 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 584 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 568 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  36.88 
 
 		 499 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 537 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 601 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 620 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  31.62 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  38.06 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  38.46 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  21.49 
 
 		 611 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 500 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 622 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 579 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.17 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 601 aa  80.9  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 493 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 592 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  22.46 
 
 		 595 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  32.26 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 607 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.54 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  54.22 
 
 		 479 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 		 519 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  30.71 
 
 		 592 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 664 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  24.53 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 507 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 477 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 591 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.88 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 556 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  31.09 
 
 		 603 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 490 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 561 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>