285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3703 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 522 aa  1082    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.76 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 480 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 506 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 498 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 529 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 494 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 500 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 486 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 473 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.17 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.79 
 
 		 498 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 485 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.88 
 
 		 490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 549 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.8 
 
 		 507 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 519 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 584 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 493 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 505 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.64 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.88 
 
 		 499 aa  100  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 447 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 521 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 531 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 549 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.09 
 
 		 532 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 502 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 519 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 521 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 540 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 564 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 592 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 601 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 508 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 508 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 613 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 571 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 579 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  25.32 
 
 		 507 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 539 aa  90.5  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 592 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>