More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0444 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 498 aa  1023    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  37.3 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  35.39 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 479 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 497 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 460 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 448 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.28 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 512 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 490 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 506 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 511 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 447 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 481 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 456 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.04 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.15 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 466 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 470 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  27.94 
 
 		 446 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 507 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.55 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.9 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 561 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 447 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 493 aa  99.8  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.33 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 531 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 508 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 531 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.09 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 594 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 503 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.89 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 464 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 451 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 499 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>