More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0547 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  915    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  50.68 
 
 		 447 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  49.33 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  48.38 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  46.22 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  44.49 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  39.38 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  31.32 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.75 
 
 		 478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  30.79 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  31.91 
 
 		 469 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  31.17 
 
 		 471 aa  150  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  29.48 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.75 
 
 		 461 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 499 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 480 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  27.9 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 490 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.08 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.57 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.49 
 
 		 498 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 508 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 498 aa  113  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 491 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 497 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  33.87 
 
 		 664 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.97 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 478 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 491 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 494 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  30.5 
 
 		 613 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 479 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 488 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 502 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 501 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  26.2 
 
 		 510 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 494 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.31 
 
 		 499 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 530 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 508 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 512 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 603 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 514 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 612 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>