288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1904 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 492 aa  1019    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  51.93 
 
 		 490 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  52.12 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  32.54 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  32.41 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  31.63 
 
 		 524 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 528 aa  207  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 476 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.43 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 502 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 527 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 530 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 481 aa  133  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.72 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 514 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.22 
 
 		 490 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 483 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 497 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 480 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 457 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 511 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  26.76 
 
 		 531 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 479 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 503 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 531 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 498 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 494 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 520 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 504 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 493 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 506 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 500 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.14 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 507 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 503 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.47 
 
 		 499 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 456 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 534 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 527 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 492 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.77 
 
 		 506 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 613 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  24.06 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.21 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 447 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 488 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 497 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 664 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  24.37 
 
 		 458 aa  93.6  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 494 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.05 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 508 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 555 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  24.9 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 480 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 539 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 527 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>