More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3578 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  64.84 
 
 		 490 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 472 aa  970    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  52.12 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  34.27 
 
 		 507 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  34.44 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  33.14 
 
 		 524 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 528 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  32.1 
 
 		 491 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 476 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 530 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 510 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 527 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.81 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 519 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 479 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 477 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.65 
 
 		 490 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 521 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  29.47 
 
 		 531 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 514 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.58 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  25.73 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 502 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 514 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 494 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 505 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.9 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 531 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 488 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 522 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 485 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.84 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 497 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 496 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 488 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 487 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 531 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  24.65 
 
 		 471 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 504 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 473 aa  90.5  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.22 
 
 		 498 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 469 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 480 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 505 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 478 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 503 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 550 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 510 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  23.55 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.03 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.2 
 
 		 458 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.95 
 
 		 532 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>