More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1984 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 461 aa  947    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  49.36 
 
 		 464 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  49.67 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  43.57 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  43.3 
 
 		 480 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  40.94 
 
 		 493 aa  343  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  41.97 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  41.81 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  40.13 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  38.98 
 
 		 469 aa  316  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  43.19 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  40.76 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  40.22 
 
 		 471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  38.61 
 
 		 472 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  38.68 
 
 		 510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  39.25 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  38.97 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  38.37 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  39.33 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  39.11 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  37.74 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  35.89 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  36.48 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  35.32 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  32.72 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 481 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  33.13 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.56 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.32 
 
 		 479 aa  170  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.75 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.44 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 447 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.9 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.66 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  31.77 
 
 		 488 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 477 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  32.21 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 494 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.98 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.5 
 
 		 460 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 470 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 473 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.99 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 456 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.66 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 508 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 497 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.13 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 496 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  28.92 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 527 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.28 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 612 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 491 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 503 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 514 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 512 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 506 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 483 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 495 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.24 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 519 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>