More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4823 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 495 aa  1025    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  38.79 
 
 		 499 aa  299  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  36.01 
 
 		 521 aa  264  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  35.53 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  32.35 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  35.73 
 
 		 521 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  34.65 
 
 		 527 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 476 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 480 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 527 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 522 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 511 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.55 
 
 		 490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 491 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 549 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 613 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 540 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 503 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 603 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  29.12 
 
 		 532 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 496 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 485 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 664 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 508 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.11 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 497 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 498 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 470 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.6 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 612 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 618 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 519 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 503 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.03 
 
 		 506 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 534 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 622 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 591 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 601 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 495 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.49 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 507 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 480 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.03 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.11 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 492 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 573 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.91 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 565 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 555 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 626 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>