More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6228 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 511 aa  1043    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  71.12 
 
 		 512 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  63.35 
 
 		 510 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  37.07 
 
 		 483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  35.67 
 
 		 481 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  36.5 
 
 		 498 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  33.97 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  33.58 
 
 		 501 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  33.85 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  33.53 
 
 		 460 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  33.14 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  35.31 
 
 		 483 aa  186  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  34.71 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  30.99 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 491 aa  177  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 514 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  32.31 
 
 		 503 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 497 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.07 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.7 
 
 		 490 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  30.22 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 523 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 520 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 499 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 495 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 499 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 506 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 534 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  31.44 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 603 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 527 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 491 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.99 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 511 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 486 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.49 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.2 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 521 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 521 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.48 
 
 		 506 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  29.19 
 
 		 458 aa  116  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 448 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 490 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  26.55 
 
 		 532 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 540 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 469 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 548 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.87 
 
 		 498 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 447 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  27.99 
 
 		 502 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 664 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 582 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 592 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>