272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4950 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  66.61 
 
 		 594 aa  827    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 592 aa  1226    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  52.34 
 
 		 576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  43.34 
 
 		 601 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  42.53 
 
 		 598 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  45.16 
 
 		 579 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  41.57 
 
 		 592 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  42.12 
 
 		 592 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  42.18 
 
 		 582 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  42.72 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  39.07 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  42.05 
 
 		 582 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  37.21 
 
 		 570 aa  335  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 556 aa  207  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.03 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 499 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 511 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.47 
 
 		 499 aa  147  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 508 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.82 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 483 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 506 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 477 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 486 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.83 
 
 		 487 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 493 aa  127  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 531 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 506 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.84 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 473 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 506 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 501 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.57 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.21 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 483 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 529 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 511 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 480 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 571 aa  97.1  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 568 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 599 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 555 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 559 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  22.58 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 488 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 565 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 565 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 500 aa  94  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 497 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  22.98 
 
 		 549 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 559 aa  93.6  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 494 aa  93.6  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.2 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  24.23 
 
 		 531 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  22.44 
 
 		 549 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 495 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 498 aa  90.9  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  22.4 
 
 		 514 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  22.08 
 
 		 548 aa  90.5  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 574 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 568 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 479 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  22.15 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 561 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  22.35 
 
 		 540 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 494 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.35 
 
 		 476 aa  88.2  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  27.16 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.55 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  22.24 
 
 		 600 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>