291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0273 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  64.62 
 
 		 582 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 582 aa  1189    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  67.99 
 
 		 579 aa  775    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  51.89 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  49.49 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  46.17 
 
 		 598 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  47.82 
 
 		 576 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  44.39 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  43.67 
 
 		 594 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  45 
 
 		 592 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  42.05 
 
 		 592 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  41.47 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  36.89 
 
 		 570 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  34.18 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 499 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 483 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.5 
 
 		 507 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.68 
 
 		 499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 493 aa  134  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.79 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.97 
 
 		 494 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.29 
 
 		 487 aa  117  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 483 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 511 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 473 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.88 
 
 		 511 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.8 
 
 		 498 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 486 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 488 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.44 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 568 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 548 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 527 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 523 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 549 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 549 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 506 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 549 aa  97.4  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 485 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 557 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 534 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 539 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 571 aa  94  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 574 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.28 
 
 		 532 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 531 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 514 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 584 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 511 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  25.85 
 
 		 507 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 493 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 504 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 582 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 561 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.41 
 
 		 511 aa  87  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 604 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  38.56 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  40.12 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  22.19 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  34.02 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  34.04 
 
 		 460 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  31.55 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>