More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3171 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 579 aa  1192    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 529 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 549 aa  190  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 531 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 531 aa  170  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 527 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 571 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.39 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 511 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 507 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 548 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 579 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 531 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 579 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 564 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 481 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  34.33 
 
 		 473 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  28.4 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 506 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 584 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 494 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 541 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.66 
 
 		 593 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 576 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.27 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 588 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 557 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  33.57 
 
 		 491 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.62 
 
 		 490 aa  117  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 555 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 565 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  34.5 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  32.06 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 540 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 629 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 583 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 506 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 587 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 639 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 623 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 615 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 592 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 631 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 601 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  34.18 
 
 		 522 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 573 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 570 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 550 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 498 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 594 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 502 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 612 aa  97.4  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.53 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 568 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  23.45 
 
 		 504 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.61 
 
 		 494 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>