276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4813 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 568 aa  1174    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  49.39 
 
 		 565 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  48.51 
 
 		 557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  40.85 
 
 		 564 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  39.83 
 
 		 571 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  37.15 
 
 		 584 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  38.4 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  35.62 
 
 		 583 aa  289  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  33.07 
 
 		 600 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  36.38 
 
 		 555 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  33.39 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  34.45 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  33.5 
 
 		 561 aa  253  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  30.68 
 
 		 599 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  32.38 
 
 		 594 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  35.2 
 
 		 559 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 568 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  33.39 
 
 		 620 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 587 aa  226  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  32.65 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  31.27 
 
 		 615 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 584 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  32.2 
 
 		 540 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  31.7 
 
 		 581 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 629 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 629 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 531 aa  193  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 638 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 642 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 623 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  32.29 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  28.59 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 626 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 527 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 639 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 625 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 636 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 677 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  30.41 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 540 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 528 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 557 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 627 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 638 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 596 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 477 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 631 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 476 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 607 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 630 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 489 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 673 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  27.24 
 
 		 666 aa  120  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 646 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 499 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 550 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 477 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 617 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 486 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.02 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 606 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 507 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.8 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 589 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 503 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 601 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 579 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.67 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>