259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1299 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 565 aa  1157    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  49.39 
 
 		 568 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  46.02 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  39.12 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  38.91 
 
 		 571 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  36.82 
 
 		 584 aa  300  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  35.67 
 
 		 566 aa  299  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  37.57 
 
 		 564 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  34.57 
 
 		 583 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  36.63 
 
 		 555 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 600 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  35.92 
 
 		 561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  33.28 
 
 		 559 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 594 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 599 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  30.55 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 620 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  31.96 
 
 		 581 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 587 aa  190  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 531 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 593 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 529 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 629 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 629 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 531 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 540 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 642 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 638 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 505 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 615 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 638 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 587 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 584 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 540 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 623 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 579 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 550 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 636 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 630 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 646 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 633 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 677 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 627 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 625 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 673 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.82 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 607 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 576 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.27 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 631 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 582 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 481 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 460 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 614 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 588 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 494 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 489 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  26.16 
 
 		 666 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 540 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 480 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 590 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 617 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 500 aa  97.4  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 589 aa  97.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 511 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 479 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.49 
 
 		 499 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 592 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 594 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 611 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 486 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>