255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2858 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 646 aa  1337    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  50.54 
 
 		 638 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  46.07 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  42.86 
 
 		 629 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  41.59 
 
 		 629 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  41.77 
 
 		 638 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  37.37 
 
 		 677 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 600 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 599 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 620 aa  220  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 584 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 571 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 565 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 564 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 673 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 615 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 594 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 561 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  36.96 
 
 		 582 aa  110  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 627 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  34.75 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  32.63 
 
 		 540 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 557 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  35.29 
 
 		 566 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  29.73 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  31.38 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 555 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  32.07 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  36.72 
 
 		 481 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  32.26 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.29 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 601 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 583 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  35.14 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  34.55 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  33.99 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 611 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  22.54 
 
 		 577 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 489 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  34.69 
 
 		 481 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.1 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  35.38 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  36.43 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  33.96 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  31.69 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  34.46 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  33.16 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.97 
 
 		 531 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 487 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 581 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 480 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 603 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  34.04 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  32.65 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.62 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  35.78 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  34.51 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 555 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>