254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0355 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 633 aa  1306    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  57.14 
 
 		 639 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  42.07 
 
 		 636 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  41.01 
 
 		 630 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 631 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 607 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 584 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 568 aa  157  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 565 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 582 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 528 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 623 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 566 aa  121  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 600 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 564 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 583 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 561 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 587 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.66 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 625 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 555 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 599 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 540 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 627 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 587 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 548 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 614 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 589 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 611 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 584 aa  87  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  23.13 
 
 		 568 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 626 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 565 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  40.6 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  21.97 
 
 		 642 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 592 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  41.18 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 629 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  21.79 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  22.44 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 550 aa  67  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 533 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 524 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  23.72 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  39.8 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  39.58 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 601 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 581 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  44.71 
 
 		 473 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  37.5 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  48.68 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  21.93 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  45.95 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  38.32 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  23.11 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  23.72 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  34.87 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  22.56 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  40.38 
 
 		 508 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>