276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6659 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 576 aa  1191    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  48.21 
 
 		 576 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  47.7 
 
 		 576 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  44.77 
 
 		 596 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  42.93 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  40.89 
 
 		 590 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  39.06 
 
 		 589 aa  359  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  36.57 
 
 		 606 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  34.92 
 
 		 611 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  31.94 
 
 		 579 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  31.28 
 
 		 540 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  32.76 
 
 		 612 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  31.81 
 
 		 550 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 602 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  28.41 
 
 		 577 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 531 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 650 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 531 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 568 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 587 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.76 
 
 		 494 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 484 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 600 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 631 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 565 aa  117  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 630 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 583 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 615 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 505 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 460 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 639 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 481 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 527 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 607 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 615 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 620 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 476 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 582 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 479 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 623 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 582 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 568 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 557 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 559 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 540 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 599 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 499 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 478 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.66 
 
 		 476 aa  91.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.9 
 
 		 499 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 488 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 510 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 633 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 627 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 527 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 489 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 485 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 594 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 521 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  21.63 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 625 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 		 617 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>