280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1019 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 566 aa  1161    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  44.17 
 
 		 568 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  35.67 
 
 		 565 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  36.17 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  34.34 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  35.5 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  32.25 
 
 		 584 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  34.43 
 
 		 564 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 600 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  34.64 
 
 		 571 aa  236  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  35.67 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  38.46 
 
 		 555 aa  200  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  30.05 
 
 		 587 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  33.19 
 
 		 531 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 531 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  34.98 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 584 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  31.55 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  33.83 
 
 		 529 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  35.07 
 
 		 559 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 615 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 623 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 587 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 629 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 642 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 582 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 594 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  31.74 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 630 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 593 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 548 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 489 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 636 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 633 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  30.07 
 
 		 666 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 631 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 477 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  31.56 
 
 		 627 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 639 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  29.96 
 
 		 550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 638 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 503 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 508 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.51 
 
 		 494 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 519 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 625 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 601 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 495 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  35.9 
 
 		 629 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 478 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 494 aa  97.8  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 491 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 481 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 506 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.73 
 
 		 487 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 596 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 486 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 589 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 501 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 502 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  24.33 
 
 		 577 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 607 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 614 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 520 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 506 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 497 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 611 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 590 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 588 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>