182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4761 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 590 aa  1209    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  61.34 
 
 		 588 aa  757    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  51.12 
 
 		 596 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  50.34 
 
 		 589 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  40.89 
 
 		 576 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  41.37 
 
 		 576 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  40.52 
 
 		 606 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  40.47 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  33.1 
 
 		 611 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 602 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  29.17 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 540 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 550 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 612 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 650 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 531 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 531 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 582 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 631 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 540 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 565 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 557 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 571 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 639 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 549 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 607 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  22.93 
 
 		 564 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 584 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 549 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 630 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 583 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 568 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 568 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.38 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 587 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 600 aa  73.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.81 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  23 
 
 		 591 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 582 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  21.22 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.24 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  21.57 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 623 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 579 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 592 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 636 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 601 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.29 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.48 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  22.69 
 
 		 568 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 598 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  21.51 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  22.49 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  40 
 
 		 508 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 534 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  36.27 
 
 		 479 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 588 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>