213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2102 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 617 aa  1285    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 599 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 584 aa  153  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 587 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 587 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 594 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 564 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 581 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 593 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 629 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 568 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 555 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 638 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 531 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 629 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 625 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 568 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 620 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 559 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 584 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 565 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 623 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 615 aa  97.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.1 
 
 		 666 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 615 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 614 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 626 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 638 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 574 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 540 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  22.65 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 646 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 582 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 527 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 677 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 549 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 588 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  22.82 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 508 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 611 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 630 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  23.34 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  22.12 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 636 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 631 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 627 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 607 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.76 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  23.48 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  21.6 
 
 		 606 aa  67  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 592 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.48 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 588 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  21.09 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  27.29 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  22.44 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 497 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  21.73 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  47.78 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 579 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  33.12 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>