273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4974 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 636 aa  1302    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  64.15 
 
 		 630 aa  846    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  42.07 
 
 		 633 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  42.81 
 
 		 639 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 607 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 631 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 615 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 568 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 557 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 593 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 594 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 565 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 571 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 600 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 561 aa  137  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 583 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 615 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 623 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 599 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 601 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 584 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 587 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 541 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 576 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 582 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 559 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 625 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 549 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 666 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 629 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 550 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 540 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 527 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 502 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 505 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 528 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 568 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  22.67 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 566 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  26.99 
 
 		 577 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 499 aa  90.5  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 511 aa  89.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 576 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 595 aa  89  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 638 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 606 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 642 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 627 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.75 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  22.29 
 
 		 638 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 617 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 480 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  22.64 
 
 		 570 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  22.34 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 520 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  22.6 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  34.81 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  42.68 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>