250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2298 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 629 aa  1303    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  50.95 
 
 		 642 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  51.42 
 
 		 629 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  48.83 
 
 		 638 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  42.56 
 
 		 638 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  42.86 
 
 		 646 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  39.39 
 
 		 677 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  32.57 
 
 		 599 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 600 aa  270  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  31.89 
 
 		 620 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 584 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 557 aa  188  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 565 aa  177  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 568 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 673 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 564 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 559 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 594 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 593 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 582 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 617 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 615 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 623 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.46 
 
 		 666 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 540 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 614 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  22.61 
 
 		 581 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 528 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 527 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 549 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 615 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  22.67 
 
 		 636 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 607 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 579 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  22.35 
 
 		 630 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 631 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  36.42 
 
 		 511 aa  90.5  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 627 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 529 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  36.67 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  34.64 
 
 		 501 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  31.28 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 626 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  33.69 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  36.42 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  33.76 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  34.67 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  39.06 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 625 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  32.62 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  33.12 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.84 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  36.53 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.41 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 664 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  33.12 
 
 		 579 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  22.13 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.54 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  34.29 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  35.19 
 
 		 582 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 500 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  22.75 
 
 		 565 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 595 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  33.08 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  21.57 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  39.22 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  33.56 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  34.18 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 481 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  32.19 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>