241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0711 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 642 aa  1335    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  50.46 
 
 		 629 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  47.91 
 
 		 629 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  46.02 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  45.9 
 
 		 646 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  41.47 
 
 		 638 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  41.92 
 
 		 677 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  31.87 
 
 		 620 aa  267  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 599 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  32.12 
 
 		 600 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 571 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 584 aa  173  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 565 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 564 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 587 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 568 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 673 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 566 aa  144  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 593 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 594 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 531 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 627 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 529 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 568 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 582 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 615 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 607 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 623 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 581 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 540 aa  99  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 549 aa  97.8  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 630 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.78 
 
 		 666 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  36.46 
 
 		 531 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  31.64 
 
 		 582 aa  94  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 528 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 579 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 579 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 636 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  34.67 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  22.66 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  35.71 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  35.95 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.88 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  21.97 
 
 		 633 aa  77.4  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 603 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  34.46 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.52 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  35.57 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 625 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  34.42 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 498 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 527 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  35.76 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.24 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.36 
 
 		 479 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  35.57 
 
 		 497 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 506 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 664 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  21.82 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  34.67 
 
 		 540 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  34.9 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  33.56 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  22.49 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.67 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  38.94 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  22.43 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  33.54 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  35.67 
 
 		 549 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  32.91 
 
 		 579 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>