276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2152 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 582 aa  1206    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  41.34 
 
 		 587 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 627 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 584 aa  240  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  31.82 
 
 		 666 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  30.27 
 
 		 568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 565 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 593 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 594 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 557 aa  163  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  31.23 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  34.58 
 
 		 555 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 559 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 583 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 600 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 629 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 540 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 623 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 494 aa  130  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 607 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 633 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 626 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 639 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 550 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 584 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 528 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 581 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.92 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 629 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 631 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 611 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 579 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 589 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 638 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 481 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 477 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 548 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 625 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 497 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 507 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 576 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 582 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.36 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 501 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 534 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 588 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 638 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 576 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 579 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 673 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 650 aa  89.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 606 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 549 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 646 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 483 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  27.52 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.62 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.65 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>