125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3772 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 606 aa  1254    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  41.27 
 
 		 596 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  41.4 
 
 		 588 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  39.36 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  40.52 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  37.48 
 
 		 576 aa  336  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  36.41 
 
 		 576 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  37.7 
 
 		 576 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  32.15 
 
 		 577 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 611 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 612 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 579 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 650 aa  144  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 550 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 540 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 631 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 568 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 571 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 584 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 527 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 531 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 587 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 531 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 582 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  22.88 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 549 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 630 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 583 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  21.64 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.31 
 
 		 666 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.22 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  22.74 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  22.14 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  21.6 
 
 		 617 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  22.9 
 
 		 491 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  22.49 
 
 		 600 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  21.86 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  22.58 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  20.88 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  21.95 
 
 		 623 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 595 aa  63.9  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  22.08 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 541 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  22.52 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  22.43 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  21.86 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  21.62 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  22.2 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 559 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 548 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 528 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 570 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 581 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 622 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  22.45 
 
 		 499 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 494 aa  51.2  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 448 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 499 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.12 
 
 		 498 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  26.03 
 
 		 557 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 528 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 488 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  21.29 
 
 		 568 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 461 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 540 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  22.17 
 
 		 594 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>