221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2248 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 596 aa  1229    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  51.12 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  51.1 
 
 		 588 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  44.77 
 
 		 576 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  42.95 
 
 		 589 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  40.58 
 
 		 606 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  42.06 
 
 		 576 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  41.86 
 
 		 576 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  32.67 
 
 		 611 aa  206  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 540 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  29.32 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 612 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 602 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 579 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 650 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 568 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 549 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 564 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 505 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 584 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 582 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 489 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 479 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 607 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 540 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 540 aa  94  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 519 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 587 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 583 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 511 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 483 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 633 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 631 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  22.87 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.65 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 587 aa  84  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 568 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 555 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 498 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 501 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.52 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 639 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 523 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 601 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 527 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  21.99 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 512 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 630 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  21.42 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  22.75 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 579 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 664 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 527 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 627 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 646 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 576 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  34.81 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  22.38 
 
 		 591 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  21.37 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  22.2 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  24.88 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  22.26 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>