177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1556 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 589 aa  1213    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  50.34 
 
 		 590 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  50.34 
 
 		 588 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  42.95 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  39.2 
 
 		 606 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  39.73 
 
 		 576 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  38.76 
 
 		 576 aa  356  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  39.06 
 
 		 576 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 577 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 602 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 557 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 550 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 557 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 531 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 568 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 612 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 571 aa  97.4  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 565 aa  97.1  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 607 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 633 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 549 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 503 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 566 aa  87  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.21 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.36 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 601 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 587 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 583 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  22.71 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 620 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 528 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 627 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  25.05 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 579 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  24.11 
 
 		 666 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.92 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 639 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 630 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  31.21 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 636 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 559 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 592 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.06 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 531 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>