255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4286 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 630 aa  1302    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  64.15 
 
 		 636 aa  846    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  41.01 
 
 		 633 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  40.92 
 
 		 639 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 607 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 631 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 584 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 571 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 600 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 615 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 557 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 594 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 566 aa  138  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 599 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 587 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 583 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 564 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 625 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 584 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 593 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 531 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  26.12 
 
 		 666 aa  117  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 561 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 601 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 620 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 611 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 587 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 559 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 629 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 540 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 505 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 550 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 642 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 576 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 582 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 588 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  22.35 
 
 		 629 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 579 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 568 aa  90.5  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 590 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 540 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 576 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  26.33 
 
 		 577 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 601 aa  79.7  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 627 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 606 aa  77  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  38.76 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  22.08 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 579 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  42.37 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 541 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  21.9 
 
 		 595 aa  71.2  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 596 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 549 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0785  RagB/SusD domain protein  39.32 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 549 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  46.07 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  34.78 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  22.81 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  49.3 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  40.43 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>