229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0785 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0785  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 511 aa  1051    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  47.89 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  25.94 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.99 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 456 aa  97.1  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.29 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.9 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 511 aa  88.2  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 504 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 448 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 462 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  24.29 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.29 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  26.13 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  23.95 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.44 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  25.42 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.26 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  26.51 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  24.04 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  22.75 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 480 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.91 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  20.22 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 488 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  22.65 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  22.7 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  21.92 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  39.32 
 
 		 630 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  22.55 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  24.42 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  22.91 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.34 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  23.53 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  48.57 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 591 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  22.11 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>