235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3147 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 482 aa  990    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  44.8 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  32.09 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.47 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  30.77 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 493 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 497 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  30.4 
 
 		 451 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 502 aa  97.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.44 
 
 		 499 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  30 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  26.1 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 481 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  25.39 
 
 		 515 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  25.49 
 
 		 466 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  26.36 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 456 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 574 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  25.47 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  26.9 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 491 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 451 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 472 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  28.35 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  27.39 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  26.26 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 502 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.58 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  27.49 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  26.35 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.46 
 
 		 458 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  30.41 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  27.35 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  22.75 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  27.3 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  26.25 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  24.17 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  23.56 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  24.74 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>